Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbbp7Q60973 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp7Q60973 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms