Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep5Q60870 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Reep5Q60870 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Reep5Q60870 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms