Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SkiQ60698 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SkiQ60698 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SkiQ60698 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms