Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgaeQ60677 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms