Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sik1Q60670 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sik1Q60670 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms