Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms