Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sin3aQ60520 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms