Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A1cfQ5YD48 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A1cfQ5YD48 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms