Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uimc1Q5U5Q9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uimc1Q5U5Q9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uimc1Q5U5Q9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Uimc1Q5U5Q9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uimc1Q5U5Q9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Uimc1Q5U5Q9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Uimc1Q5U5Q9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Uimc1Q5U5Q9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Uimc1Q5U5Q9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Uimc1Q5U5Q9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uimc1Q5U5Q9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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