Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms