Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam71bQ5STT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms