Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TefmQ5SSK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TefmQ5SSK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms