Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv2-2Q5R1A4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv2-2Q5R1A4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms