Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CoblQ5NBX1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CoblQ5NBX1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms