Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp28Q5I043 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp28Q5I043 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms