Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spire1Q52KF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms