Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc84Q4VA36 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms