Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430531B16RikQ3V2J1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms