Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc27Q3V036 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms