Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cfap74Q3UY96 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cfap74Q3UY96 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfap74Q3UY96 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms