Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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Kdm5aQ3UXZ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms