Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thsd4Q3UTY6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms