Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1lQ3USQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1lQ3USQ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms