Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms