Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms