Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem253Q3UNB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem253Q3UNB8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms