Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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