Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spg7Q3ULF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spg7Q3ULF4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms