Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trafd1Q3UDK1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms