Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pid1Q3UBG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms