Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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