Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms