Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U595 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U595 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U595 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U595 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U595 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U595 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U595 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U595 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U595 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U595 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms