Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms