Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd1Q3TXS7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd1Q3TXS7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms