Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calr4Q3TQS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms