Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Smarca4Q3TKT4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Smarca4Q3TKT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Smarca4Q3TKT4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms