Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms