Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prex2Q3LAC4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prex2Q3LAC4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prex2Q3LAC4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prex2Q3LAC4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms