Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms