Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
StumQ0VBF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
StumQ0VBF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms