Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem52bQ0VBF2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem52bQ0VBF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms