Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms