Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrioQ0KL02 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TrioQ0KL02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrioQ0KL02 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms