Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 RET1YOR207C 3450 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 SRB7YDR308C 423 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YJR141WYJR141W 1044 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YKL153WYKL153W 510 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 COS9YKL219W 1224 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 CDC73YLR418C 1182 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 FPR3YML074C 1236 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 SCS7YMR272C 1155 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 MDJ2YNL328C 441 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 PLP2YOR281C 861 nt5.55□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 CAD1YDR423C 1230 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 TYS1YGR185C 1185 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 SOL3YHR163W 750 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 BCY1YIL033C 1251 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 GLG2YJL137C 1143 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 RPS3YNL178W 723 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 RRG9YNL213C 645 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 BUD17YNR027W 954 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YBL112CYBL112C 318 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 ERI1YPL096C-A 207 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 POL30YBR088C 777 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YSY6YBR162W-A 198 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 ASH1YKL185W 1767 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 MCM3YEL032W 2916 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 RFA1YAR007C 1866 nt5.54□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 TMA64YDR117C 1698 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 IBA57YJR122W 1494 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 WHI2YOR043W 1461 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 MGT1YDL200C 567 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YIL028WYIL028W 399 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YJL147CYJL147C 1149 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YKL023WYKL023W 834 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 PAU17YLL025W 375 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 FYV7YLR068W 456 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 DDR48YMR173W 1293 nt5.53□□□□□ -1.52
BRE4Q07660 HSF1YGL073W 2502 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 ROG3YFR022W 2202 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 HST3YOR025W 1344 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 OXP1YKL215C 3861 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 TIP20YGL145W 2106 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 CUP2YGL166W 678 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YJL193WYJL193W 1209 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YMR252CYMR252C 405 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SCS22YBL091C-A 528 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YPL077CYPL077C 723 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YPR015CYPR015C 744 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 ZWF1YNL241C 1518 nt5.52□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 FAR10YLR238W 1437 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SMF2YHR050W 1650 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 HSP42YDR171W 1128 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YDR187CYDR187C 519 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 RPL24AYGL031C 468 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SIP2YGL208W 1248 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 VPS25YJR102C 609 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 ELO3YLR372W 1038 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YTM1YOR272W 1383 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YJR061WYJR061W 2808 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 CST6YIL036W 1764 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 MNN2YBR015C 1794 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YCR015CYCR015C 954 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YDR053WYDR053W 396 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YDR445CYDR445C 408 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SNZ3YFL059W 897 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 NQM1YGR043C 1002 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 MMF1YIL051C 438 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 ILM1YJR118C 612 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 PRM6YML047C 1059 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SAM37YMR060C 984 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YBL077WYBL077W 432 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SNZ2YNL333W 897 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YOR029WYOR029W 336 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 MCA1YOR197W 1299 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 ETR1YBR026C 1143 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 snR3snR3 194 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 TAE1YBR261C 699 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 UTP5YDR398W 1932 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 MIG1YGL035C 1515 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 IDP1YDL066W 1287 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 PMP3YDR276C 168 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 BUD32YGR262C 786 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YAP3YHL009C 993 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 NMA1YLR328W 1206 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 YML084WYML084W 309 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 SNO1YMR095C 675 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 RMI1YPL024W 726 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE4Q07660 MEI5YPL121C 669 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms