Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrstQ06666 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrstQ06666 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms