Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms