Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelaQ04207 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelaQ04207 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RelaQ04207 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms