Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NfiaQ02780 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms