Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb4Q02738 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms