Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms